Modellering van het dynamische landschap van "fenotype switching" in melanomen

Het uitgezaaid melanoom is één van de meest aggressieve en moeilijk behandelbare kankers. Sinds kort kunnen patiënten met specifieke mutaties in oncogenen en tumorsupressorgenen behandeld worden met bepaalde medicatie, maar bijna alle patiënten worden hiertegen resistent en ontwikkelen weerbarstige uitzaaiingen die hen uiteindelijk fataal worden. Alternatieve therapiëen die het immuunsysteem van de patiënt versterken kunnen langetermijnseffecten hebben, maar slaan enkel aan in een beperkt aantal patiënten, en wederom is resistentie problematisch. Eén mechanisme voor ontwikkeling van resistentie is de neiging van melanoomcellen om heen en weer te switchen van een therapiegevoelig naar een -resistent fenotype (“fenotype switching”). Bijkomend stelt deze switch melanoomcellen in staat om zich te verplaatsen in het lichaam en dus om uitzaaiingen te veroorzaken.
Om deze gepersonaliseerde therapiëen te verbeteren, en om het risico op herval te voorspellen, is het cruciaal om de onderliggende moleculaire mechanismen te begrijpen en de genregulatoire netwerken te reconstrueren. Tot nu toe gebeurde het meeste onderzoek echter op de fenotypes in rusttoestand, en was het grotendeels enkel gebaseerd op profilering van genexpressie. Dit project heeft als doel het karakteriseren van de DNA structuur en genregulatoire netwerken onderliggend aan de dynamiek van de transities tussen de fenotypes, met als uiteindelijk doel het moduleren van dit proces en interfereren met melanoomontwikkeling.