Diepe genomische profilering van perifeer T-cel lymfomen om patiënten stratificatie en uitkomst te verbeteren.

Perifeer T-cel Lymfoom (PTCL) is een zeldzaam en heterogeen type van non-Hodgkin Lymfomen afkomstig van mature T-lymfocyten. Tot dusver zijn verschillende subtypes geïdentificeerd, maar ~30% van de gevallen onttrekt zich aan classificatie (PTCL-NOS, not otherwise specified). Doelgerichte behandelingen ontbreken en de prognose is bijzonder slecht voor deze patiënten. Leukemieën en lymfomen herbergen vaak meerdere kankercelpopulaties met verschillende genetische varianten (d.w.z. subclonen), die kunnen bijdragen tot resistentie tegen behandeling en terugval. De zeldzaamheid van PTCL-NOS heeft echter uitgebreid onderzoek naar de genetische onderbouwing en heterogeniteit ervan verhinderd, wat op zijn beurt de ontwikkeling van nieuwe therapieën heeft belemmerd.
In dit project zal ik het genetische landschap van PTCL-NOS karakteriseren aan de hand van een uniek cohort van 28 patiënten met diepe whole-genome en transcriptome sequencing data. Ik zal subclonalen populaties karakteriseren en licht werpen op de evolutionaire trajecten van PTCL-NOS. Deze analyses zullen belangrijke inzichten verschaffen betreffend de identificatie van (niet-)coderende drivers, mutatieprocessen en de patronen van inter- en intratumor heterogeniteit die PTCL-NOS kenmerken. Samen zal dit project de zoektocht naar therapeutische targets helpen ontsluiten en een opstap vormen naar klinische studies in PTCL-NOS.